ديڤيد چ. ليپمان
ديڤيد چ. ليپمان هو عالم أحياء أمريكى شغل من سنة 1989 لسنة 2017 منصب مدير المركز الوطنى لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) فى المعاهد الوطنية للصحة .[4][5] NCBI هو موطن GenBank,[6] العقدة الامريكانيه لاتحاد قاعدة بيانات التسلسل الدولي, و PubMed, واحد من اكتر المواقع استخدام فى العالم للبحث عن المعلومات الطبية الحيوية واسترجاعها. يعتبر ليپمان واحد من المؤلفين الأصليين لبرنامج محاذاة تسلسل بلاست ، وشخصية محترمة فى مجال المعلوماتية الحيوية .[7] و سنة 2017، غادر NCBI و بقا مدير للعلوم فى شركة Impossible Foods .[8]
| ||||
---|---|---|---|---|
معلومات شخصيه | ||||
الميلاد | سنة 1954 (العمر 69–70 سنة)[1] | |||
مواطنه | امريكا | |||
عضو فى | الاكاديميه الوطنيه للعلوم ، والاكاديميه الامريكانيه للفنون و العلوم | |||
الحياه العمليه | ||||
المدرسه الام | جامعة براون (التخصص:بيولوجيا ) (الشهادة:بكالوريوس فنون )[3] | |||
تخصص اكاديمى | بيولوجيا | |||
شهاده جامعيه | بكالوريوس فنون | |||
المهنه | بايولوچيست | |||
اللغات المحكيه او المكتوبه | انجليزى | |||
مجال العمل | بيو-انفورماتيكا | |||
موظف فى | المركز الوطنى الامريكانى لمعلومات التكنولوجيا الحيويه | |||
تعديل مصدري - تعديل |
تعليم
تعديلليپمان اخد شهادته الجامعية من جامعة براون ودرجة الدكتوراه فى الطب سنة 1980 من جامعة بوفالو، جامعة ولاية نيو يورك [9]
حياة مهنية
تعديلكان ليپمان المدير المؤسس للمركز الوطنى لمعلومات التكنولوجيا الحيوية ، و هو جزء من المكتبة الوطنية للطب فى المعاهد الوطنية للصحة بالولايات المتحدة. تحت قيادته، نما NCBI من أقل من عشرة أشخاص لاكتر من 500 موظف علمي، و هو يستضيف دلوقتى مئات من قواعد البيانات العلمية والطبية بما فيها GenBank و PubMed و PubMed Central وdbGaP وdbSNP و أرشيف قراية التسلسل (SRA) وRefSeq وPubChem، و غيرها الكثير. تضمن برنامج البحث الداخلى فى NCBI مجموعات بقيادة ستيفن ألتشول (مؤلف مشارك آخر فى بلاست)، وديفيد لاندسمان، ويوجين كونين [10] (مؤلف غزير الإنتاج فى علم الجينوم المقارن )، و إل أرافيند.
يشتهر ليپمان بعمله الرائد فى سلسلة من خوارزميات تشابه التسلسل، بدايه من خوارزمية ويلبر-ليپمان [11] سنة 1983، وبحث FASTA [12][13] سنة 1985، وBLAST [14] سنة 1990، وGapped. انفجار وPSI-BLAST [15] سنة 1997. بقا BLAST فى النهاية برنامج محاذاة التسلسل الاكتر استخدام والاكتر استشهادًا (اكتر من 160.000 استشهادًا من سنة 2021) فى ده المجال، ويعد خادم NCBI BLAST اليوم واحد من موارده الاكتر استخدامًا.
عمل ليپمان كمان لسنين كتيرة مع دينيس أ. بنسون وتانيين فى NCBI على صيانة وتحسين GenBank ، واحده من اكبر قواعد البيانات فى العالم لبيانات تسلسل الجينوم والبروتين. يشكل بنك الجينات مع أرشيف النوكليوتيدات الأوروبى وبنك بيانات الحمض النووى فى اليابان التعاون الدولى لقاعدة بيانات تسلسل النوكليوتيدات (INSDC)، هيا قاعدة بيانات مفتوحة بالكامل و مش مقيدة لتسلسلات الجينوم اللى كانت يعتبر المستودع العالمى لمثل دى البيانات من سنة 1990.[16][17][18]
كان واحد من منشئى مشروع تسلسل جينوم الأنفلونزا ، و هو مشروع لتسلسل و إتاحة جينومات الآلاف من عزلات فيروسات الأنفلونزا.
كان واحد من الموقعين الأصليين على بيان بيثيسدا بخصوص النشر المفتوح الوصول .
وهو كمان رئيس تحرير مجلة علمية على الإنترنت مفتوحة الوصول ومراجعة النظراء تسمى Biology Direct .[19]
فى مايو 2017، ترك ليپمان منصبه فى NCBI لينضم لشركة اللحوم النباتية Impossible Foods كمسؤول علمى رئيسي.[20]
الجوايز والتكريمات
تعديلليپمان اخد جايزة مرافق الموارد الجزيئية الحيوية لمساهماته البارزة فى التقنيات الجزيئية الحيوية سنة 1996.
و سنة 2000، تم انتخابه لعضوية الأكاديمية الوطنية للطب .[21]
سنة 2004، اخد جايزة ISCB لكبار العلما وانتخب زميل فى ISCB سنة 2009 على ايد الجمعية الدولية للبيولوجيا الحاسوبية .[22]
و سنة 2005، تم انتخاب الدكتور ليپمان عضو فى الأكاديمية الوطنية الامريكانيه للعلوم .
و سنة 2013، اخد جايزة بطل التغيير من البيت الأبيض فى مجال "العلم المفتوح".[23][24]
و سنة 2023، اخد جايزة مؤسسة وارن ألبرت .[25]
مصادر
تعديل- ↑ https://www.amacad.org/multimedia/pdfs/publications/bookofmembers/ChapterL.pdf
- ↑ https://web.archive.org/web/20170211080242/https://irp.nih.gov/pi/david-lipman
- ↑ https://www.globalmicrobialidentifier.org/news-and-events/previous-meetings/3rd-meeting-on-gmi
- ↑ "David J. Lipman, MD, Director, National Center for Biotechnology Information". مؤرشف من الأصل في 2013-09-26.
- ↑ "Open Access Now | Conversation with David Lipman". Biomedcentral.com. مؤرشف من الأصل في 2011-06-29. اطلع عليه بتاريخ 2011-07-02.
- ↑ Benson، D. A.؛ Karsch-Mizrachi، I.؛ Lipman، D. J.؛ Ostell، J.؛ Wheeler، D. L. (2007). "GenBank". Nucleic Acids Research. ج. 36 ع. Database issue: D25–D30. DOI:10.1093/nar/gkm929. PMC:2238942. PMID:18073190.
- ↑ "david lipman – Google Scholar". Scholar.google.com. اطلع عليه بتاريخ 2017-03-26.
- ↑ "National Library of Medicine Announces Departure of NCBI Director Dr. David Lipman". www.nlm.nih.gov. اطلع عليه بتاريخ 2017-05-05.
- ↑ "David J. Lipman, M.D. Biography". nih.gov. مؤرشف من الأصل في 2017-02-11. اطلع عليه بتاريخ 2017-02-09.
- ↑ Tatusov، R. L.؛ Koonin، E. V.؛ Lipman، D. J. (1997). "A Genomic Perspective on Protein Families". Science. ج. 278 ع. 5338: 631–637. Bibcode:1997Sci...278..631T. DOI:10.1126/science.278.5338.631. PMID:9381173.
- ↑ Wilbur، W. J.؛ Lipman، D. J. (1983). "Rapid similarity searches of nucleic acid and protein data banks". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 80 ع. 3: 726–730. Bibcode:1983PNAS...80..726W. DOI:10.1073/pnas.80.3.726. PMC:393452. PMID:6572363.
- ↑ Lipman، D.؛ Pearson، W. (1985). "Rapid and sensitive protein similarity searches". Science. ج. 227 ع. 4693: 1435–1441. Bibcode:1985Sci...227.1435L. DOI:10.1126/science.2983426. PMID:2983426.
- ↑ Pearson، W. R.؛ Lipman، D. J. (1988). "Improved tools for biological sequence comparison". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 85 ع. 8: 2444–2448. Bibcode:1988PNAS...85.2444P. DOI:10.1073/pnas.85.8.2444. PMC:280013. PMID:3162770.
- ↑ Altschul، Stephen؛ Gish، Warren؛ Miller، Webb؛ Myers، Eugene؛ Lipman، David (1990). "Basic local alignment search tool". Journal of Molecular Biology. ج. 215 ع. 3: 403–410. DOI:10.1016/S0022-2836(05)80360-2. PMID:2231712.
- ↑ Altschul، S.؛ Madden، T. L.؛ Schäffer، A. A.؛ Zhang، J.؛ Zhang، Z.؛ Miller، W.؛ Lipman، D. J. (1997). "Gapped BLAST and PSI-BLAST: A new generation of protein database search programs". Nucleic Acids Research. ج. 25 ع. 17: 3389–3402. DOI:10.1093/nar/25.17.3389. PMC:146917. PMID:9254694.
- ↑ Benson، D. A.؛ Cavanaugh، M.؛ Clark، K.؛ Karsch-Mizrachi، I.؛ Lipman، D. J.؛ Ostell، J.؛ Sayers، E. W. (2012). "GenBank". Nucleic Acids Research. ج. 41 ع. Database issue: D36–D42. DOI:10.1093/nar/gks1195. PMC:3531190. PMID:23193287.
- ↑ Benson، D. A.؛ Karsch-Mizrachi، I.؛ Clark، K.؛ Lipman، D. J.؛ Ostell، J.؛ Sayers، E. W. (2011). "GenBank". Nucleic Acids Research. ج. 40 ع. Database issue: D48–D53. DOI:10.1093/nar/gkr1202. PMC:3245039. PMID:22144687.
- ↑ Benson، D. A.؛ Karsch-Mizrachi، I.؛ Lipman، D. J.؛ Ostell، J.؛ Sayers، E. W. (2010). "GenBank". Nucleic Acids Research. ج. 39 ع. Database issue: D32–D37. DOI:10.1093/nar/gkq1079. PMC:3013681. PMID:21071399.
- ↑ "Biology Direct | Editorial board". مؤرشف من الأصل في 2011-09-30. اطلع عليه بتاريخ 2011-10-28.
- ↑ "National Library of Medicine Announces Departure of NCBI Director Dr. David Lipman". www.nlm.nih.gov. اطلع عليه بتاريخ 2017-05-04.
- ↑ "Institute of Medicine Elects New Members".
- ↑ "ISCB Names 2004 Senior Scientist Accomplishment Award Winner, Dr. David Lipman ISCB Newsletter 7-3". Iscb.org. اطلع عليه بتاريخ 2011-07-02.
- ↑ "Open Science | the White House". whitehouse.gov. مؤرشف من الأصل في 2017-01-21. اطلع عليه بتاريخ 2016-04-02.
- ↑ "Dr. David Lipman Receives White House "Open Science" Champions of Change Award on Behalf of NCBI". Ncbi.nlm.nih.gov. اطلع عليه بتاريخ 2016-04-02.
- ↑ Warren Alpert Foundation Prize 2023