ديڤيد چ. ليپمان

ديڤيد چ. ليپمان هو عالم أحياء أمريكى شغل من سنة 1989 لسنة 2017 منصب مدير المركز الوطنى لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI) فى المعاهد الوطنية للصحة .[4][5] NCBI هو موطن GenBank,[6] العقدة الامريكانيه لاتحاد قاعدة بيانات التسلسل الدولي, و PubMed, واحد من اكتر المواقع استخدام فى العالم للبحث عن المعلومات الطبية الحيوية واسترجاعها. يعتبر ليپمان واحد من المؤلفين الأصليين لبرنامج محاذاة تسلسل بلاست ، وشخصية محترمة فى مجال المعلوماتية الحيوية .[7] و سنة 2017، غادر NCBI و بقا مدير للعلوم فى شركة Impossible Foods .[8]

ديڤيد چ. ليپمان
 

معلومات شخصيه
الميلاد سنة 1954 (العمر 69–70 سنة)[1]  تعديل قيمة خاصية تاريخ الولاده (P569) في ويكي بيانات


روتشستر [2]  تعديل قيمة خاصية مكان الولاده (P19) في ويكي بيانات

مواطنه
امريكا   تعديل قيمة خاصية الجنسيه (P27) في ويكي بيانات
عضو فى الاكاديميه الوطنيه للعلوم ،  والاكاديميه الامريكانيه للفنون و العلوم   تعديل قيمة خاصية عضو في (P463) في ويكي بيانات
الحياه العمليه
المدرسه الام جامعة براون (التخصص:بيولوجيا ) (الشهادة:بكالوريوس فنون )[3]  تعديل قيمة خاصية اتعلم فى (P69) في ويكي بيانات
تخصص اكاديمى بيولوجيا   تعديل قيمة خاصية اتعلم فى (P69) في ويكي بيانات 
شهاده جامعيه بكالوريوس فنون   تعديل قيمة خاصية اتعلم فى (P69) في ويكي بيانات
المهنه بايولوچيست   تعديل قيمة خاصية الوظيفه (P106) في ويكي بيانات
اللغات المحكيه او المكتوبه انجليزى   تعديل قيمة خاصية اللغه (P1412) في ويكي بيانات
مجال العمل بيو-انفورماتيكا   تعديل قيمة خاصية مجال العمل (P101) في ويكي بيانات
موظف فى المركز الوطنى الامريكانى لمعلومات التكنولوجيا الحيويه   تعديل قيمة خاصية ربُّ العمل (P108) في ويكي بيانات

تعليم

تعديل

ليپمان اخد شهادته الجامعية من جامعة براون ودرجة الدكتوراه فى الطب سنة 1980 من جامعة بوفالو، جامعة ولاية نيو يورك [9]

حياة مهنية

تعديل

كان ليپمان المدير المؤسس للمركز الوطنى لمعلومات التكنولوجيا الحيوية ، و هو جزء من المكتبة الوطنية للطب فى المعاهد الوطنية للصحة بالولايات المتحدة. تحت قيادته، نما NCBI من أقل من عشرة أشخاص لاكتر من 500 موظف علمي، و هو يستضيف دلوقتى مئات من قواعد البيانات العلمية والطبية بما فيها GenBank و PubMed و PubMed Central وdbGaP وdbSNP و أرشيف قراية التسلسل (SRA) وRefSeq وPubChem، و غيرها الكثير. تضمن برنامج البحث الداخلى فى NCBI مجموعات بقيادة ستيفن ألتشول (مؤلف مشارك آخر فى بلاست)، وديفيد لاندسمان، ويوجين كونين [10] (مؤلف غزير الإنتاج فى علم الجينوم المقارن )، و إل أرافيند.

يشتهر ليپمان بعمله الرائد فى سلسلة من خوارزميات تشابه التسلسل، بدايه من خوارزمية ويلبر-ليپمان [11] سنة 1983، وبحث FASTA [12][13] سنة 1985، وBLAST [14] سنة 1990، وGapped. انفجار وPSI-BLAST [15] سنة 1997. بقا BLAST فى النهاية برنامج محاذاة التسلسل الاكتر استخدام والاكتر استشهادًا (اكتر من 160.000 استشهادًا من سنة 2021) فى ده المجال، ويعد خادم NCBI BLAST اليوم واحد من موارده الاكتر استخدامًا.

عمل ليپمان كمان لسنين كتيرة مع دينيس أ. بنسون وتانيين فى NCBI على صيانة وتحسين GenBank ، واحده من اكبر قواعد البيانات فى العالم لبيانات تسلسل الجينوم والبروتين. يشكل بنك الجينات مع أرشيف النوكليوتيدات الأوروبى وبنك بيانات الحمض النووى فى اليابان التعاون الدولى لقاعدة بيانات تسلسل النوكليوتيدات (INSDC)، هيا قاعدة بيانات مفتوحة بالكامل و مش مقيدة لتسلسلات الجينوم اللى كانت يعتبر المستودع العالمى لمثل دى البيانات من سنة 1990.[16][17][18]

كان واحد من منشئى مشروع تسلسل جينوم الأنفلونزا ، و هو مشروع لتسلسل و إتاحة جينومات الآلاف من عزلات فيروسات الأنفلونزا.

كان واحد من الموقعين الأصليين على بيان بيثيسدا بخصوص النشر المفتوح الوصول .

وهو كمان رئيس تحرير مجلة علمية على الإنترنت مفتوحة الوصول ومراجعة النظراء تسمى Biology Direct .[19]

فى مايو 2017، ترك ليپمان منصبه فى NCBI لينضم لشركة اللحوم النباتية Impossible Foods كمسؤول علمى رئيسي.[20]

الجوايز والتكريمات

تعديل

ليپمان اخد جايزة مرافق الموارد الجزيئية الحيوية لمساهماته البارزة فى التقنيات الجزيئية الحيوية سنة 1996.

و سنة 2000، تم انتخابه لعضوية الأكاديمية الوطنية للطب .[21]

سنة 2004، اخد جايزة ISCB لكبار العلما وانتخب زميل فى ISCB  سنة  2009 على ايد الجمعية الدولية للبيولوجيا الحاسوبية .[22]

و سنة 2005، تم انتخاب الدكتور ليپمان عضو فى الأكاديمية الوطنية الامريكانيه للعلوم .

و سنة 2013، اخد جايزة بطل التغيير من البيت الأبيض فى مجال "العلم المفتوح".[23][24]

و سنة 2023، اخد جايزة مؤسسة وارن ألبرت .[25]

مصادر

تعديل
  1. https://www.amacad.org/multimedia/pdfs/publications/bookofmembers/ChapterL.pdf
  2. https://web.archive.org/web/20170211080242/https://irp.nih.gov/pi/david-lipman
  3. https://www.globalmicrobialidentifier.org/news-and-events/previous-meetings/3rd-meeting-on-gmi
  4. "David J. Lipman, MD, Director, National Center for Biotechnology Information". Archived from the original on 2013-09-26.
  5. "Open Access Now | Conversation with David Lipman". Biomedcentral.com. Archived from the original on 29 June 2011. Retrieved 2 July 2011.
  6. Benson, D. A.; Karsch-Mizrachi, I.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Wheeler, D. L. (2007). "GenBank". Nucleic Acids Research. 36 (Database issue): D25–D30. doi:10.1093/nar/gkm929. PMC 2238942. PMID 18073190.
  7. "david lipman – Google Scholar". Scholar.google.com. Retrieved 2017-03-26.
  8. "National Library of Medicine Announces Departure of NCBI Director Dr. David Lipman". www.nlm.nih.gov. Retrieved 2017-05-05.
  9. "David J. Lipman, M.D. Biography". nih.gov. Archived from the original on 2017-02-11. Retrieved 2017-02-09.
  10. Tatusov, R. L.; Koonin, E. V.; Lipman, D. J. (1997). "A Genomic Perspective on Protein Families". Science. 278 (5338): 631–637. Bibcode:1997Sci...278..631T. doi:10.1126/science.278.5338.631. PMID 9381173.
  11. Wilbur, W. J.; Lipman, D. J. (1983). "Rapid similarity searches of nucleic acid and protein data banks". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 80 (3): 726–730. Bibcode:1983PNAS...80..726W. doi:10.1073/pnas.80.3.726. PMC 393452. PMID 6572363.
  12. Lipman, D.; Pearson, W. (1985). "Rapid and sensitive protein similarity searches". Science. 227 (4693): 1435–1441. Bibcode:1985Sci...227.1435L. doi:10.1126/science.2983426. PMID 2983426.
  13. Pearson, W. R.; Lipman, D. J. (1988). "Improved tools for biological sequence comparison". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 85 (8): 2444–2448. Bibcode:1988PNAS...85.2444P. doi:10.1073/pnas.85.8.2444. PMC 280013. PMID 3162770.
  14. Altschul, Stephen; Gish, Warren; Miller, Webb; Myers, Eugene; Lipman, David (1990). "Basic local alignment search tool". Journal of Molecular Biology. 215 (3): 403–410. doi:10.1016/S0022-2836(05)80360-2. PMID 2231712.
  15. Altschul, S.; Madden, T. L.; Schäffer, A. A.; Zhang, J.; Zhang, Z.; Miller, W.; Lipman, D. J. (1997). "Gapped BLAST and PSI-BLAST: A new generation of protein database search programs". Nucleic Acids Research. 25 (17): 3389–3402. doi:10.1093/nar/25.17.3389. PMC 146917. PMID 9254694.
  16. Benson, D. A.; Cavanaugh, M.; Clark, K.; Karsch-Mizrachi, I.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Sayers, E. W. (2012). "GenBank". Nucleic Acids Research. 41 (Database issue): D36–D42. doi:10.1093/nar/gks1195. PMC 3531190. PMID 23193287.
  17. Benson, D. A.; Karsch-Mizrachi, I.; Clark, K.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Sayers, E. W. (2011). "GenBank". Nucleic Acids Research. 40 (Database issue): D48–D53. doi:10.1093/nar/gkr1202. PMC 3245039. PMID 22144687.
  18. Benson, D. A.; Karsch-Mizrachi, I.; Lipman, D. J.; Ostell, J.; Sayers, E. W. (2010). "GenBank". Nucleic Acids Research. 39 (Database issue): D32–D37. doi:10.1093/nar/gkq1079. PMC 3013681. PMID 21071399.
  19. "Biology Direct | Editorial board". Archived from the original on 2011-09-30. Retrieved 2011-10-28.
  20. "National Library of Medicine Announces Departure of NCBI Director Dr. David Lipman". www.nlm.nih.gov. Retrieved 2017-05-04.
  21. "Institute of Medicine Elects New Members".
  22. "ISCB Names 2004 Senior Scientist Accomplishment Award Winner, Dr. David Lipman ISCB Newsletter 7-3". Iscb.org. Retrieved 2 July 2011.
  23. "Open Science | the White House". whitehouse.gov. Archived from the original on 2017-01-21. Retrieved 2016-04-02.
  24. "Dr. David Lipman Receives White House "Open Science" Champions of Change Award on Behalf of NCBI". Ncbi.nlm.nih.gov. Retrieved 2 April 2016.
  25. Warren Alpert Foundation Prize 2023